Jaki VAT i CIT przy ulepszeniu budynku galerii handlowej

Y spółka z o.o. (podatnik VAT czynny) jest właścicielem budynku galerii handlowej. Budynek został nabyty przez spółkę w maju 2017 r. i w tym samym miesiącu wprowadzony do ewidencji środków trwałych. Wartość początkowa budynku wynosi 12 500 000 zł. Jest amortyzowany metodą liniową z zastosowaniem ustawowej 2,5-proc. rocznej stawki amortyzacyjnej. Pierwszego odpisu amortyzacyjnego spółka dokonała za czerwiec 2017 r. w wysokości 26 041,67 zł (12 500 000 zł x 2,5 proc. : 12 m-cy). Łącznie od czerwca 2017 r. do maja 2019 r. spółka Y dokonała odpisów amortyzacyjnych w wysokości 625 000,08 zł (26 041,67 zł x 24 m-ce). W maju 2019 r. spółka zmodernizowała budynek za 123 000 zł, w tym VAT: 23 000 zł. Nakłady te zostały udokumentowane fakturą wystawioną 28 maja 2019 r. przez firmę X na 123 000 zł brutto. Spółka otrzymała tę fakturę 28 maja 2019 r. i została ona opłacona przelewem na rachunek firmy X 4 czerwca 2019 r. Ulepszenie spółka oddała do używania 30 maja 2019 r., zwiększając o jego wartość (100 000 zł netto) wartość początkową tego środka trwałego (30 maja 2019 r.). Od momentu nabycia tego budynku były to pierwsze ulepszenia, jakie spółka poniosła na przedmiotowy budynek. Wartość poniesionych nakładów nie była refakturowana na najemców. Jak spółka powinna rozliczyć poniesione nakłady na gruncie VAT i podatku dochodowego (KUP)? Budynek jest w całości wynajmowany, a w związku z tym spółka opłaca podatek od przychodów z budynków. Czy poniesione nakłady na ulepszenie wpłyną na podatek od przychodów z budynków? Spółka nie posiada innych nieruchomości komercyjnych, od których pobiera się podatek od przychodów z budynku, ani udziału w kapitale innych spółek, które posiadają takie budynki. Rokiem podatkowym spółki jest rok kalendarzowy. VAT i zaliczki na CIT spółka rozlicza za okresy miesięczne.