Jak rozliczyć pracującego w systemie równoważnym, który wykonuje zadania rano i po południu

Pracownik zatrudniony na stanowisku kuriera w systemie równoważnym w miesięcznych okresach rozliczeniowych wykonuje pracę w taki sposób, że rozpoczyna zadania o 6.00 rano i rozwozi paczki do ok. 11.00, następnie korzysta z 3 godzin przerwy i kontynuuje rozwożenie przesyłek do adresatów w godzinach od 14.00 do 18.00. Jak prawidłowo rozliczyć jego czas pracy, jeśli pracodawcy zdarza się zlecać mu dodatkowo pracę w nadgodzinach dobowych? Jak traktować nadgodziny w trakcie przerwy występujące między okresami świadczenia pracy i w jaki sposób naliczyć za nie wynagrodzenie i dodatki, jeśli kurier poza pensją zasadniczą w stałej stawce miesięcznej 2000 zł otrzymuje prowizję od liczby dostarczonych paczek?