Sojusz na rzecz bioinformatyki i genomiki

Idea stworzenia centrum łączącego badania genomiczne i bioinformatyczne jest konsekwentnie realizowana już od kilku lat. Dzięki grantom wspólnie zdobytym przez PP oraz IChB PAN została zakupiona część sprzętu niezbędnego dla zainicjowania działalności Europejskiego Centrum Bioinformatyki i Genomiki. Szczególnie cennym osiągnięciem organizacyjnym było skompletowanie prawie pełnego zestawu urządzeń i programów komputerowych potrzebnych do samodzielnego projektowania, wytwarzania i analizy mikromacierzy DNA, systemu do rozdziału i analizy białek metodą elektroforezy dwukierunkowej oraz zestawu aparatów umożliwiających analizę wpływu ekspresji wybranych genów lub transgenów na metabolizm komórkowy.

Głównym zadaniem ECBiG jest prowadzenie badań podstawowych w zakresie bioinformatyki, genomiki strukturalnej, genomiki funkcjonalnej i proteomiki, rozwój i wdrażanie nowych oraz już istniejących metod badawczych, jak i praktyczne wykorzystanie uzyskanych wyników w medycynie, biotechnologii oraz rolnictwie.

Obecnie w ramach ECBiG prowadzone są prace z następujących dziedzin: projektowanie, produkcja i praktyczne wykorzystanie mikromacierzy DNA i RNA; zastosowanie mikromacierzy DNA oraz technologii RNAi w badaniach genomu ludzkiego oraz wybranych genomów roślinnych; zastosowanie metod bioinformatycznych w analizie genomów; opracowanie i implementacja algorytmów umożliwiających projektowanie i analizę mikromacierzy DNA i RNA; obliczeniowa analiza strukturalna i sekwencyjna białek i RNA; algorytmiczna analiza sekwencjonowania i asemblacji DNA; identyfikacja nowych regulatorowych RNA, a szczególnie mikroRNA; masowa identyfikacja i analiza białek oraz terapeutyczne wykorzystanie technologii RNAi (siRNA, mikroRNA).

- Utworzyliśmy w Poznaniu silny ośrodek, który może poszczycić się znacznymi osiągnięciami w zakresie rozwoju bioinformatyki. Algorytmy przez nas opracowane są konkurencyjne w skali światowej - mówi prof. dr hab. inż. Jacek Błażewicz z Instytutu Informatyki Politechniki Poznańskiej, koordynator całego projektu "Rozwoju Infrastruktury Europejskiego Centrum Bioinformatyki i Genomiki". - Coraz szerszy zakres badań ECBiG oraz olbrzymie zainteresowanie współpracą ze strony licznych ośrodków badawczych w Polsce i za granicą wiążą się jednak z koniecznością dokonania dalszych istotnych inwestycji aparaturowych - dodaje.

Dzięki pozytywnej decyzji Rektora Politechniki Poznańskiej, w uznaniu osiągnięć, cała dotychczasowa infrastruktura ECBiG, jak i ta zakupiona w ramach projektu, zostanie przeniesiona do nowo wybudowanego Centrum Wykładowego Politechniki Poznańskiej. Do końca tego roku zostaną uruchomione laboratoria sekwencjonowania i genomiki strukturalnej, proteomiki, genomiki funkcjonalnej oraz bioinformatyki. Będą one tworzyły efektywną strukturę badawczą, skupiając całą ścieżkę badań genomicznych i bioinformatycznych w jednym miejscu oraz umożliwiając powiązanie wszystkich poziomów analiz - strukturalnych, funkcjonalnych i proteomicznych.

- Dzięki nowej aparaturze będziemy mogli poznać proces ekspresji informacji genetycznej na wszystkich poziomach - mówi prof. dr hab. Marek Figlerowicz, koordynator zadań Instytutu Chemii Bioorganicznej PAN w projekcie. - Realizacja tego projektu inwestycyjnego pozwoli nam także na pełne uczestnictwo w pracach międzynarodowych sieci badawczych oraz umożliwi realizację wielu projektów badawczych - dodaje.

Zdobyta wiedza znajdzie zastosowanie w diagnostyce i terapii medycznej, farmacji oraz w projektowaniu i wytwarzaniu nowych produktów biotechnologicznych.

W perspektywie długookresowej rezultaty prowadzonych badań w ECBiG mogą pozwolić na stosowanie medycyny spersonalizowanej w leczeniu chorób nowotworowych i wirusowych. Rozbudowana baza genomiczna pozwoli w przyszłości na skuteczne dopasowanie leku do profilu genetycznego danej osoby. - Technologie rozwijane w ECBiG pozwolą stwierdzić, w jakim zakresie u danego człowieka genom jest uszkodzony bądź dysfunkcyjny. Pozwolą określić także, jaka konfiguracja białek odpowiada za rozwój danej jednostki chorobowej. Otworzy to drogę do skutecznej terapii genowej - dodaje prof. Figlerowicz.

Oprócz współpracy badawczej w ramach ECBiG z Instytutem Chemii Bioorganicznej, Politechnika Poznańska rozwija także bioinformatykę na gruncie dydaktycznym. Rezultatem tego jest uruchomienie w październiku ubiegłego roku makrokierunku bioinformatyka, wspólnie z Uniwersytetem im. Adama Mickiewicza w Poznaniu.

Andrzej Majewski

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.101.jpg@RY2@

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.102.jpg@RY2@

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.103.jpg@RY2@

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.104.jpg@RY2@

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.105.jpg@RY2@

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.106.jpg@RY2@

@RY1@i02/2011/040/i02.2011.040.127.012a.107.jpg@RY2@