Podatnik może zgłosić zastrzeżenia do kontroli

Na zakończenie kontroli sporządza się protokół w dwóch jednobrzmiących egzemplarzach. Jeden otrzymuje przedsiębiorca, u którego przeprowadzona została kontrola. Jeśli nie zgadza się on z ustaleniami zawartymi w protokole, może w terminie 14 dni od dnia doręczenia protokołu przedstawić zastrzeżenia lub wyjaśnienia, wskazując stosowne wnioski dowodowe. Kontrolujący musi w ciągu 14 dni od dnia ich otrzymania zawiadomić podatnika o sposobie ich załatwienia. Jeśli jakieś zastrzeżenia nie zostały uwzględnione, musi uzasadnić, dlaczego.