Gminy na razie nie muszą bać się o zwrot VAT

Instytucje zarządzające programami unijnymi do czasu wydania wyroku przez Trybunał Sprawiedliwości UE nie będą starały się odzyskać od gmin VAT, który był kosztem kwalifikowanym.

Samorządy, które realizowały inwestycje dofinansowane z funduszy unijnych oraz otrzymały środki na zapłatę podatku od towarów i usług (przynajmniej częściowo), mogą na razie spać spokojnie. Po uchwale NSA z 24 czerwca 2013 r. (sygn. akt I FPS 1/13), który orzekł, że podatnikiem VAT jest gmina, a nie jej jednostki budżetowe, samorządowcy obawiali się, że będą musieli zwracać VAT, który był kosztem kwalifikowanym inwestycji. Jeśli gmina odzyskałaby zapłacony podatek od polskiego fiskusa, to nie mógłby on być kosztem kwalifikowanym i musiałaby go zwrócić instytucji zarządzającej.

Ministerstwo Infrastruktury i Rozwoju (MIR) uspokaja jednak samorządy.

- MIR poinformowało poszczególne instytucje zarządzające programami operacyjnymi (krajowymi i regionalnymi), że do czasu rozstrzygnięcia przez Trybunał Sprawiedliwości UE, czy gminne jednostki budżetowe są podatnikami VAT (o takie rozstrzygnięcie wystąpił Naczelny Sąd Administracyjny), należy wstrzymać wszelkie działania zmierzające do odzyskania tego podatku kwalifikowanego uprzednio w realizowanych projektach - wyjaśnił DGP Piotr Popa, rzecznik prasowy MIR.

Jak mówi Andrzej Kapczuk, doradca podatkowy i starszy menedżer w EY, stanowisko resortu to dobra wiadomość dla gmin.

- W sytuacji gdy Ministerstwo Finansów czeka na rozstrzygnięcie trybunału i od tego uzależnia dalsze kroki, również MIR powinno poczekać - stwierdza Andrzej Kapczuk.

Piotr Popa wyjaśnia, że po uchwale NSA resort w piśmie z 20 września 2013 r. informował o zmianie podejścia dotyczącego uznawania jednostek budżetowych za podatników VAT, jak również sugerował służbom kontrolnym zwrócenie uwagi na problem VAT podczas prowadzonych czynności kontrolnych. Jak dodaje, pojawianie się w związku z uchwałą NSA możliwości odzyskania podatku od towarów i usług z budżetu państwa w niektórych projektach mogłoby skutkować koniecznością zwrotu kwalifikowanego uprzednio VAT. Resort informował, że nawet jeśli gmina będzie musiała go zwrócić, to nie będzie zobowiązana do płacenia karnych odsetek. Później jednak NSA zwrócił się do TSUE o rozstrzygnięcie, czy jednostka budżetowa jest podatnikiem VAT. Ministerstwo Finansów poinformowało więc MIR, że w takiej sytuacji trudno uznać za właściwą jakąkolwiek ingerencję w rozliczenia VAT dokonywane przez gminy.

Andrzej Kapczuk wyjaśnia jednak, że jeśli gmina ma możliwość odzyskania tego podatku w związku z inwestycjami od polskiego fiskusa, to może na tym skorzystać, nawet jeśli będzie musiała zwrócić pieniądze do instytucji zarządzającej danym programem unijnym. Ekspert tłumaczy, że zawsze UE dofinansowywała część VAT (był to koszt kwalifikowany), natomiast gmina może odzyskać 100 proc. podatku. W efekcie kilkadziesiąt procent daniny może zostać w jej budżecie. Ekspert dodaje jednak, że do każdego rozliczenia VAT trzeba podejść indywidualnie.

W nowej perspektywie finansowej VAT będzie kosztem kwalifikowanym

Łukasz Zalewski

 lukasz.zalewski@infor.pl